Расчёт пеней при налоговых доначислениях - это точка, где формальная арифметика ФНС и реальные правовые позиции судов расходятся чаще, чем принято считать. Ошибки в базе начисления, неверно определённая дата возникновения недоимки и игнорирование мораторных периодов приводят к тому, что итоговая сумма пеней в решении по проверке оказывается завышена. В 2026 году арбитражные суды продолжают формировать практику, которая даёт бизнесу конкретные инструменты для оспаривания. Этот материал - рабочий чеклист: что проверить, где искать ошибку и как выстроить позицию.
Пени по налогам - это денежная сумма, которую налогоплательщик обязан уплатить сверх недоимки за каждый календарный день просрочки. Правовая основа - статья 75 НК РФ. Норма устанавливает три ключевых параметра: базу начисления (сумму недоимки), период начисления (с дня, следующего за установленным сроком уплаты, по день фактического погашения) и ставку.
Для организаций ставка пеней дифференцирована. За первые 30 дней просрочки - одна трёхсотая ключевой ставки ЦБ РФ, с 31-го дня - одна стопятидесятая. Это правило действует с 2017 года, однако в периоды действия временных мораториев ставка фиксировалась на уровне одной трёхсотой вне зависимости от длительности просрочки. Неочевидный риск состоит в том, что ФНС при расчёте не всегда корректно учитывает переходные периоды между мораторием и стандартным режимом.
Ключевая ставка ЦБ РФ применяется та, которая действовала в соответствующий день просрочки. Если ставка менялась в течение периода, расчёт должен быть разбит на отрезки. На практике важно учитывать, что инспекция нередко применяет единую ставку ко всему периоду - это прямая ошибка, которую суды исправляют.
Первый шаг при получении акта выездной или камеральной проверки - запросить детальный расчёт пеней. Инспекция обязана его предоставить: это требование статьи 100 НК РФ применительно к акту и статьи 101 НК РФ применительно к решению. Расчёт должен содержать базу, период, ставку и итоговую сумму по каждому налогу и каждому периоду отдельно.
Проверяйте по следующим позициям:
Чтобы получить чеклист проверки расчёта пеней по вашей конкретной ситуации, направьте запрос на info@bizdroblenie.ru.
Арбитражные суды в 2026 году продолжают линию, заложенную Верховным Судом РФ в предшествующие годы. Несколько направлений заслуживают особого внимания.
Пени при налоговой реконструкции. Когда инспекция переквалифицирует схему дробления бизнеса и доначисляет налоги по общей системе, возникает вопрос: с какой даты считать пени. Суды последовательно указывают, что пени не могут начисляться ранее, чем налогоплательщик получил возможность исполнить обязательство в реконструированном размере. Если реконструкция проведена только в ходе проверки, начало периода - дата вступления решения в силу, а не дата первоначального срока уплаты налога. Эта позиция принципиальна: разница в сумме пеней при доначислениях за три года может составлять десятки миллионов рублей.
Пени при оспаривании основного доначисления. Если налогоплательщик оспаривает решение инспекции в суде и суд принимает обеспечительные меры в виде приостановления исполнения решения, пени за период действия обеспечительных мер не начисляются. Это прямо следует из статьи 75 НК РФ и подтверждено позицией Верховного Суда РФ. Распространённая ошибка - не заявлять ходатайство об обеспечительных мерах при подаче заявления в арбитражный суд. Каждый месяц без обеспечения при крупном доначислении - это дополнительные пени, которых можно было избежать.
Пени при частичной отмене решения. Если вышестоящий налоговый орган или суд отменяет решение инспекции в части, пени пересчитываются пропорционально. Инспекция не всегда делает это автоматически - налогоплательщику нужно направить отдельное требование о корректировке лицевого счёта. Суды признают бездействие инспекции в этой части незаконным.
Пени и амнистия при добровольном уточнении. Налогоплательщик, самостоятельно подавший уточнённую декларацию и уплативший налог до начала проверки, освобождается от штрафа по статье 122 НК РФ, но не от пеней. Пени начисляются в любом случае - это принципиальное отличие от штрафа. Многие недооценивают этот момент при планировании добровольного уточнения.
Сценарий первый: малый бизнес на УСН, доначисление за один год. Инспекция доначислила налог по итогам камеральной проверки. Сумма недоимки - несколько миллионов рублей. В расчёте пеней инспекция не учла переплату по тому же налогу, существовавшую в первом квартале проверяемого года. Налогоплательщик подаёт возражения на акт в течение одного месяца, прикладывает выписку из лицевого счёта. Инспекция корректирует расчёт. Итог - снижение пеней без судебного спора.
Сценарий второй: средний бизнес, выездная проверка, дробление. Доначисление по НДС и налогу на прибыль за три года на сумму свыше 50 млн рублей. Пени рассчитаны с даты первоначального срока уплаты. Налогоплательщик оспаривает решение в арбитражном суде, заявляет ходатайство об обеспечительных мерах. Суд приостанавливает исполнение решения. Параллельно в апелляционной жалобе в УФНС ставится вопрос о неверном начале периода начисления пеней с учётом позиции о реконструкции. УФНС частично соглашается. Итог - снижение пеней на значительную часть и прекращение их начисления на период судебного спора.
Сценарий третий: крупный холдинг, доначисление по трансфертному ценообразованию. Расчёт пеней охватывает период с изменениями ключевой ставки ЦБ РФ. Инспекция применила единую ставку ко всему периоду. Налогоплательщик представил собственный расчёт с разбивкой по отрезкам. Суд принял позицию налогоплательщика. Разница в итоговой сумме пеней составила несколько миллионов рублей.
Чтобы получить чеклист проверки пеней применительно к вашему доначислению и типу проверки, направьте запрос на info@bizdroblenie.ru.
Первая и наиболее частая ошибка - оспаривать только основное доначисление, не формулируя самостоятельных возражений по пеням. Суды рассматривают пени как производное требование, но это не означает автоматического пересчёта при снижении недоимки. Позицию по пеням нужно формулировать отдельно и аргументировать независимо.
Вторая ошибка - пропуск срока на подачу апелляционной жалобы в УФНС. Срок составляет один месяц с даты вручения решения. Если решение не обжаловано в апелляционном порядке, оно вступает в силу, и оспорить его в суде становится значительно сложнее. Досудебный порядок по статьям 137-139.1 НК РФ обязателен.
Третья ошибка - не запрашивать детальный расчёт пеней на стадии возражений. Без расчёта невозможно выявить арифметические и методологические ошибки. Инспекция обязана предоставить расчёт по запросу налогоплательщика.
Четвёртая ошибка - игнорировать вопрос о зачёте переплаты. Переплата по налогу того же уровня бюджета перекрывает недоимку и исключает начисление пеней на перекрытую сумму. Это требует активной позиции: налогоплательщик должен сам заявить о наличии переплаты и подтвердить её документально.
Пятая ошибка - не заявлять ходатайство об обеспечительных мерах при подаче заявления в арбитражный суд. Суд рассматривает такое ходатайство в течение одного дня. Если ходатайство удовлетворено, пени перестают начисляться на период спора. При крупных доначислениях это существенная экономия.
Возражения на акт проверки подаются в инспекцию в течение одного месяца с даты получения акта. В возражениях нужно отдельным разделом оспорить расчёт пеней с приложением собственного расчёта.
Если решение вынесено и пени в нём сохранены, следующий шаг - апелляционная жалоба в УФНС. Срок - один месяц. УФНС рассматривает жалобу в течение одного месяца, в сложных случаях - до двух месяцев.
После получения решения УФНС налогоплательщик вправе обратиться в арбитражный суд. Срок - три месяца с даты получения решения УФНС. Заявление подаётся в электронном виде через систему «Мой арбитр». Государственная пошлина по имущественным требованиям зависит от суммы оспариваемых доначислений.
На стадии арбитражного суда первой инстанции рассмотрение занимает от трёх до шести месяцев. Апелляция - ещё два-три месяца. Кассация в арбитражном суде округа - три-четыре месяца. Верховный Суд РФ принимает к рассмотрению дела, имеющие существенное значение для формирования практики.
Расходы на юридическое сопровождение спора по пеням зависят от суммы доначисления и стадии. При доначислениях свыше нескольких десятков миллионов рублей расходы на сопровождение от возражений до кассации начинаются от сотен тысяч рублей. Экономика решения очевидна: при правильно выстроенной позиции снижение пеней перекрывает расходы на защиту.
Могут ли пени превысить сумму основного налогового доначисления?
Да, при длительной просрочке и высокой ключевой ставке ЦБ РФ пени могут превысить основную недоимку. Статья 75 НК РФ не устанавливает верхнего предела для пеней - они начисляются за каждый день просрочки без ограничения общей суммы. Именно поэтому при крупных доначислениях за несколько лет вопрос о корректности расчёта пеней становится самостоятельным предметом спора. Оспаривание даже части периода или базы начисления может дать значимый финансовый результат.
Что происходит с пенями, если суд отменяет решение инспекции полностью?
При полной отмене решения инспекции судом пени, начисленные на основании этого решения, также подлежат отмене как производное требование. Инспекция обязана скорректировать лицевой счёт налогоплательщика. Если уплата пеней уже была произведена - возникает право на возврат или зачёт переплаты по статье 79 НК РФ. На практике инспекция не всегда проводит корректировку автоматически: налогоплательщику нужно направить отдельное заявление о возврате с приложением вступившего в силу судебного акта.
Стоит ли оспаривать пени отдельно от основного доначисления или только вместе с ним?
Оспаривать пени отдельно имеет смысл в двух ситуациях: когда основное доначисление признано правомерным, но в расчёте пеней есть методологические или арифметические ошибки, и когда часть доначисления уже отменена, а инспекция не пересчитала пени. В остальных случаях позиция по пеням формулируется в рамках единого спора об оспаривании решения. Разделение требований увеличивает процессуальную нагрузку и не всегда оправдано. Выбор стратегии зависит от суммы спора, стадии и конкретных оснований для оспаривания.
Расчёт пеней - технически сложный элемент налогового спора, который часто остаётся вне фокуса при оспаривании доначислений. Ошибки в базе, периоде и ставке встречаются в актах проверок регулярно. Судебная практика 2026 года даёт налогоплательщикам конкретные правовые позиции для снижения пеней - от реконструкции до учёта переплаты. Использование этих инструментов требует последовательной работы на каждой стадии: от возражений до кассации.
Чтобы получить чеклист проверки расчёта пеней по вашему делу и оценить перспективы оспаривания, направьте запрос на info@bizdroblenie.ru.
Команда bizdroblenie.ru сопровождает бизнес в спорах и проектах, связанных с налоговыми доначислениями, расчётом пеней и оспариванием решений налоговых органов. Мы можем помочь с проверкой расчёта пеней, подготовкой возражений и апелляционных жалоб, а также с выстраиванием позиции в арбитражном суде. Чтобы получить консультацию, напишите на info@bizdroblenie.ru.